• EccDNA定量PCR服务技术

     

     

     

    技术简介：

     

    游离于染色体基因组之外的DNA (extrachromosomal DNA，ecDNA)被发现常常以环状的形式存在，这种形式的DNA被称为环状DNA (extrachromosomal circular DNA，eccDNA）。目前也习惯将巨大的环状DNA(>1Mb)称为ecDNA, 而将相对较小的环状DNA称为eccDNA。
    传统观点认为真核基因组通常形成稳定的线性染色体。但最新的研究表明：无论是在正常体细胞还是癌细胞中，都存在大量染色体外环状DNA。近日，Nature杂志上发表了颠覆性研究成果：在肿瘤中，主要的癌基因转录本是直接来自于环状DNA的，而环状DNA的染色质是高度开放的，环状DNA的癌基因能够大量表达，同时缺乏丝粒，导致不遵照孟德尔定律进行遗传，这种特性使得环状DNA是驱动肿瘤异质性的重要机制。由此可见，由于其结构和表达的特异性，环状DNA可以影响细胞生命活动，促进肿瘤细胞演进和适应性进化，增加了基因组的可塑性和不稳定性。目前，环状DNA不仅仅可以作为一种新型特异的肿瘤标志物，还在肿瘤发生发展机理研究中发挥着重大的潜在价值。可以预见的是，环状DNA将迅速成为新的科研热点，甚至会对传统遗传学和基因组学带来革命性影响。

     

     

     

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    案例1：晚期高级别浆液性卵巢癌染色体外环状 DNA 的全局表征

    原文：Global characterization of extrachromosomal circular DNAs in advanced high grade serous ovarian cancer

    期刊：Cell Death & Disease    影响因子：8.1     发表时间：2022/3

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    案例2：血清eccDNA SORBS1circ水平升高与新诊断的 2 型糖尿病患者的胰岛素抵抗有关

     

    原文：Increased serum extrachromosomal circular DNA SORBS1circle level is associated with insulin resistance in patients with newly diagnosed type 2 diabetes  mellitus

     

    期刊：Cellular & Molecular Biology Letters   影响因子：9.2   发表时间：2024/1

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

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    ​​​​​​​2 型糖尿病(T2DM)是一种严重、复杂的慢性疾病其特征是高血糖和胰岛素抵抗。与正常对照(NC)受试者相比，T2DM 患者血清或血浆中游离 DNA 和线粒体 DNA 浓度的显著变化已被证实。然而，目前缺乏关于 T2DM 患者 eccDNA的已发表数据。 在本研究中对新诊断的 T2DM 患者和 NC 受试者的血清 eccDNA 进行了表征，并将SORBS1circle的 SH3结构域确定为一种新的 eccDNA。 通过eccDNA-qPCR和对PCR产物的eccDNA sanger测序，SORBS1circle已被验证为T2DM 患者血清中上调最显著eccDNA。此外，我们确定了eccDNA SORBS1circle在新诊断的 T2DM 患者队列中的临床价值，发现eccDNA SORBS1circle的增加与胰岛素抵抗相关。最后，我们已经证明，由凋亡 DNA 片段化产生的 eccDNA SORBS1circle在高葡萄和棕榈酸酯(HG/PA)诱导的 HepG2细胞胰岛素抵抗模型中显著增强。

     

  • 云序技术优势：

     

    • 云序生物提供一站式环状DNA实时定量PCR技术服务，包括：DNA抽提，DNA质控，环状DNA特异性引物设计，环状DNA qPCR检测。并提供详细的实验报告和实验数据。

     

  • 样本要求：

     

    细胞、组织、血清血浆、抽提好的 eccDNA 等。

技术服务

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