• Cut&Tag技术

     

     

     

    技术简介：

     

    CUT&Tag（Cleavage Under Targets and Tagmentation）是蛋白质-DNA互作关系研究的新方法，是新一代超微量ChIP-Seq技术，适用于无ChIP级别抗体的蛋白研究。与传统的ChIP-Seq研究方法相比，该技术无需交联、超声打断、末端抹平和接头连接等操作，因此具有省时高 效、所需的样品量少、背景信号低和可重复性好等优点，甚至可用于单细胞水平测序。CUT&Tag有望将蛋白质-DNA互作的研究变成一种类似PCR反应的常规操作，对基因调控、表观遗传等领域的研究具有革命性的意义。

     

    技术原理

     ChiTag是Protein A蛋白与Tn5转座酶的融合蛋白，当抗体结合目的蛋白（如转录因子、组蛋白等）后，Protein A蛋白可直接结合抗体，携带的Tn5转座酶可特异性的切割目的蛋白附近的DNA片段，并将DNA片段连上接头，文库构建之后可进行高通量测序。 

     

    云序生物CUT&Tag实验流程

     

    图注：云序生物CUT&Tag实验流程

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  • 高分文章案例

     

    案例1：CUT&Tag技术研究蛋白质-DNA互作的优势

     

    原文：CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells

     

    期刊：Nature Communications             影响因子：11.878

     

    在生物学研究中，DNA与蛋白质之间的互作是至关重要的，参与基因的表达、调控、复制、重组和修复以及RNA的转运、翻译和调控等多个过程，几乎涉及所有的生命活动。目前研究两者互作的方法很多，作者选择了传统的研究手段ChIP-seq，优化的CUT&RUN方法，以及新方法CUT&Tag共同研究组蛋白H3K27me3。通过比对实验结果，发现CUT&Tag有zui低的背景噪声以及较强的信号。通过对H3K4me1修饰物进行分析，显示CUT&Tag的灵敏度zui高，实验可重复性zui好。 

    CUT&Tag方法的优点

    图1. CUT&Tag方法的优点

  • 云序技术优势：

     

    样品起始量低：能够对及少量样品进行分析

     

    无需ChIP级别抗体：无需提供ChIP级别抗体

     

    性价比高：背景噪音低，所需测序深度少

     

    实验重复性好：实验重复结果一致性好

     

  • 样本要求：

     

    样品类型：细胞、组织，其它样品信息请详询

    样品量

    细胞：2×10^6

    组织：50mg

    样品保存：细胞样品或新鲜组织块，液氮冻存后，-80℃ 保存。

    样品运输：干冰运输。

技术服务

Technical Service

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