• 5hmC cfDNA/ctDNA羟甲基化测序技术

     

     

     

    技术简介：

     

    cfDNA（Cell free DNA）是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中的降解的DNA小片段，是一种新型的分子标记物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿 瘤细胞的cfDNA，是液体活检主流方向。
    报道表明：cfDNA/ctDNA羟甲基化不仅可以作为肿 瘤分子标志物，还可用于追溯肿 瘤细胞的组织来源。在医疗大趋势下，cfDNA/ctDNA羟甲基化检测既具有较高的科研价值，又具备推进医疗临床实践的潜能，为实现肿 瘤临床治 疗的全病程管理提供强有力的支持。利用cfDNA羟甲基化测序，仅凭一管液体就可以进行肿 瘤诊断、疗效评估、实时监控、个体化用药、预测复发等，是里程碑式的新型液体活检技术。
    云序生物较早推出cfDNA/ctDNA羟甲基化测序服务，低仅需20ng cFDNA/ctDNA既可进行测序。客户仅需提供血浆，血清或体液样本，云序生物为您完成从cfDNA/ctDNA提取，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。

    ctDNA甲基化来源

    图1.cfDNA/ctDNA羟基化来源

     

    具临床应用前景的分子标志物-----cfDNA/ctDNA羟基化

    ctDNA甲基化研究应用范围
    图2. cfDNA/ctDNA羟基化研究应用范围


    1. 癌症早筛界明星：cfDNA/ctDNA羟基化与癌症发展各时期关系密切，特别是癌症早期。

    ctDNA甲基化与癌症发展各时期关系密切，特别是癌症早期

     

    2. 鉴定癌症有效手段：癌症组中cfDNA/ctDNA羟基化水平与正常组差异明显。cfDNA/ctDNA羟基化基因的有效性（AUC：0.816）远高于传统分子标志物AFP（AUC：0.969）。

        癌症组中ctDNA甲基化水平与正常组差异明显。ctDNA甲基化基因的有效性（AUC：0.816）远高于传统分子标志物AFP（AUC：0.969）癌症组中ctDNA甲基化水平与正常组差异明显。ctDNA甲基化基因的有效性（AUC：0.816）远高于传统分子标志物AFP（AUC：0.969）

    3.助力药 物或其他手段治 疗效果评估：在治 疗过程中，cfDNA/ctDNA羟基化水平与癌细胞数量呈正比，可用于协助评估用药疗效、复发及治 疗后期转移动态的监测。

     在治 疗过程中，ctDNA甲基化水平与ai细胞数量呈正比，可用于协助评估用药疗效、复发及治 疗后期转移动态的监测。
    在治 疗过程中，ctDNA甲基化水平与ai细胞数量呈正比，可用于协助评估用药疗效、复发及治 疗后期转移动态的监测。在治 疗过程中，ctDNA甲基化水平与ai细胞数量呈正比，可用于协助评估用药疗效、复发及治 疗后期转移动态的监测。

     

    高影响因子文章利器-----cfDNA/ctDNA羟基化

    近年来已发表期刊（部分）
    图3. 近年来已发表期刊（部分）
    高 分期刊评语（ctDNA甲基化适用于分子标志物）
    图4. 高影响因子期刊评语（cfDNA/ctDNA羟基化适用于分子标志物）

     

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  • 高分文章案例

     

    案例1：ctDNA羟甲基化可作为人类ai症诊断的分子标志物

     

    原文：5-Hydroxymethylcytosine signatures in circulating cell-free DNA as diagnostic biomarkers for human cancers

    期刊：Cell Research                               影响因子：15

     

    本篇文章的作者是复旦大学华山医院的刘杰教授课题组与芝加哥大学何川教授课题组合作通过检测不同癌症样本中ctDNA羟甲基化分布和水平。本文通过ctDNA羟甲基化检测技术，在全基因组范围内，检测癌症与健康人中ctDNA羟甲基化的水平。检测的癌症类型包括肠癌，胃癌，胰腺癌，肝癌，甲状腺癌，检测组织类型包括癌症及癌旁组织，血浆和白血球。结果发现，5hmC主要分布在基因组的转录活性区，可能与开放染色质和允许组蛋白修饰相关。同时，5hmC对特定癌症类型高敏感，如癌和胃癌。总的来说，ctDNA羟甲基化检测为日后仅通过血浆样本进行无创诊断奠定了良好的基础。

     

    不同类型疾病中，ctDNA羟甲基化可用于分子标志物研究


    图1. 不同类型疾病中，ctDNA羟甲基化可用于分子标志物研究

     

    ctDNA羟甲基化可区分组织类型


    图2. ctDNA羟甲基化可区分组织类型   

     

    在肠癌和健康组中，单个基因羟甲基化水平的一致性很高


    图3. 在肠癌和健康组中，单个基因羟甲基化水平的一致性很高

     

    肠癌的不同分期中，ctDNA羟甲基化水平不同


    图4. 肠癌的不同分期中，ctDNA羟甲基化水平不同

     

    胃癌及肠癌的ctDNA羟甲基化检出率很高

     

    图5. 胃癌及肠癌的ctDNA羟甲基化检出率很高

  • 云序技术优势：

     

    一站式服务：客户只需提供样本，云序生物为您完成从cfDNA/ctDNA提取，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。


    特异性富集ctDNA/ctDNA片段：云序生物具有丰富样本处理经验，采用cfDNA/ctDNA提取试剂盒，富集效率高。


    严格质控流程：云序生物质控流程严格，层层把关，为客户提供高准确度的结果。


    专业化生物信息分析：云序生物强大生物信息团队，满足客户个性化数据分析要求。

     

  • 样本要求：

     

    样品类型：血清、血浆、体液等。其他样本类型请详询。

     

    样品量：

    血清，血浆：≥5 mL;

    体液：请详询。

     

    样品保存： 血清、血浆、体液样品，液氮速冻后-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。

    样品运输：样品置于1.5 mL管中，封口膜封好，干冰运输。

     

技术服务

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