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cfRNA修饰测序技术
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技术简介:
cfRNA(Cell-freeRNA)作为血液、唾液等体液中的动态分子信使,涵盖mRNA、miRNA、lncRNA等全转录组信息。cfRNA表达谱的动态变化可反映组织病理状态,其检测在癌症早筛、疗效监测等领域展现出巨大潜力。近年来,RNA修饰的研究揭示了其在基因表达调控中的关键作用,如m6A(N6-甲基腺苷)、m5C(5-甲基胞嘧啶)、ac4C(N4-乙酰胞苷)等修饰通过影响RNA稳定性、翻译效率和亚细胞定位,参与肿瘤发生、神经退行性疾病等病理过程。 传统cfRNA检测仅关注表达量,而修饰位点与丰度的动态变化更具疾病特异性与早期预警价值。作为cfRNA和RNA修饰研究领域的创新者,云序生物融合cfRNA测序和MeRIP测序的优势,推出cfRNA修饰测序服务,开启液体活检新时代。该技术在cfRNA测序的基础上全面升级,在捕获cfRNA后以免疫共沉淀的方法捕获带有特定修饰的cfRNA片段,并配合高通量测序技术,实现转录组范围内cfRNA的甲基化区域的检测。
cfRNA RNA修饰实验流程
云序优势
1.超微量RNA修饰测序
体液中微量的cfRNA对后续免疫共沉淀及测序提出极大的挑战。云序生物超微量RNA修饰测序对免疫共沉淀和高通量测序步骤进行优化,克服常规抗体富集至少需要100μg总RNA的难题,仅需500ng cfRNA即可实验,适用于检测微量及珍贵样本中的cfRNA。
2.MeRIP实验质控金标准 Spike-In(以m6A为例)
云序生物MeRIP-Seq(Spike-In Plus)测序在实验过程中加入两类人工合成的spike in,分别为阳性Spike-In(带m6A修饰的序列)和阴性Spike-In(不带修饰的序列),与样品一起进行MeRIP-Seq实验,根据Spike in的检测信号对MeRIP实验进行质控,来确保实验流程的准确性、重复性及抗体的特异性。
3.高效富集cfRNA
云序生物提供一站式cfRNA修饰测序流程,涵盖样本处理、cfRNA提取、免疫共沉淀、高通量测序和后续生物信息学分析整套服务。
4.核心修饰全覆盖
可检测包括m6A、m1A、m7G、ac4c、假尿苷等热门修饰,全面表征cfRNA转录修饰图谱,具体修饰类型请电询。
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关于我们
云序生物是国家高新技术企业及ISO9001认证单位,以RNA修饰组、表观遗传组与时空组学为特色,依托高通量测序平台,以“技术创新+全链条服务”为核心,通过专利技术应用(如GLORI)、临床微量样本技术优化及单细胞-空间多组学整合能力,持续推动表观遗传与转录组学发展。
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