RNA修饰结合蛋白的质谱鉴定技术

 

 

 

技术简介：

 

RNA Pull-down结合质谱分析（RNA Pull-down-MS）技术是研究RNA结合蛋白的核心实验方法之一。它的核心思想是利用体外转录或化学合成的、带有特定标签的目标RNA分子作为“诱饵”，从复杂的细胞裂解液或蛋白混合物中“钓取”（Pull-down）能够特异性结合该RNA的蛋白质。随后，将这些捕获的蛋白质通过高灵敏度的质谱（Mass Spectrometry, MS）进行鉴定和定量分析。

在RNA修饰研究领域，对于像ac4C这类部分关键调控因子（如特异的eraser和reader）尚未被发现的修饰，RNA Pull-down-MS技术提供了一种强有力的解决方案：人工合成带有ac4c修饰的探针，“钓取”能够特异性结合ac4c修饰的蛋白，从而明确介导ac4c修饰的效应蛋白。

该技术的成功应用高度依赖于高质量的修饰标记RNA探针（“诱饵”）。同时，为了有效应对非特异性结合的挑战，保证结果的准确性，此类研究必须额外合成并使用严格匹配的、不带修饰的RNA探针作为阴性对照。通过比较修饰探针组与未修饰对照组的Pull-down结果，可以显著排除非特异性结合蛋白的干扰，精准鉴定出真正特异地结合目标修饰（如ac4C）的蛋白质。

云序生物依托成熟的修饰探针合成技术，独家提供带特定修饰的探针及其匹配的未修饰对照探针，实现高灵敏、高特异性的RNA Pull-Down-质谱/MS服务，为研究人员（尤其是研究新型RNA修饰及其结合蛋白的研究者）提供强有力的工具来挖掘关键RNA结合蛋白。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

RNA Pull-down-MS服务流程

              

 

 

 

 

 

 

 

产品列表：

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

*其他RNA修饰类型产品请电询

 

 

 

 

 

云序服务优势：

独家修饰探针合成： 云序生物独家提供多种RNA修饰探针（m6A、m7G、m5C、O8G、ac4C、m1A等），覆盖全、特异性强、富集效率高、背景低。

真正一站式服务： 客户只需提供细胞或组织，云序生物为您完成从探针合成→RNA提取→富集→质谱分析→生信分析整套服务流程。

全流程质控体系： 从探针合成到蛋白鉴定，每一步骤均经过严格质量管控，确保数据可靠、结果可重复。

深度机制解析： 高灵敏度质谱发掘未知互作蛋白，提供完整互作图谱，解析RNA调控功能、信号通路及疾病相关机制。

 

应用场景

发现特定修饰RNA结合蛋白（RBP）

验证关键调控蛋白的互作关系

解析疾病相关修饰RNA的调控网络

探索表观遗传调控新通路