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糖基化RNA糖组质谱技术
产品列表:
糖基化RNA(GlycoRNA)是一类位于活细胞表面、带有糖基化修饰的小的非编码RNA(small non-coding, sncRNAs),包括tRNA、YRNA、小核RNA(snRNA)、小核仁RNA(snoRNA)、核糖体RNA(rRNA)等【1】。功能研究表明,glycoRNA可以和细胞膜表面的RNA结合蛋白(csRBPs)形成纳米级簇状结构,调控反式转录激活因子(TAT)穿透细胞膜进入胞内发挥功能【2】。作为分子识别的核心元件,glycoRNA上的聚糖在结构上与糖蛋白中的聚糖类似,同样可分为N-连接聚糖和O-连接聚糖。聚糖组分介导了中性粒细胞的glycoRNA与内皮细胞的P选择素(P-selectin)识别过程,促进中性粒细胞对内皮细胞的粘附和迁移,在中性粒细胞向炎症部位募集的过程中发挥了重要作用【3】。进一步解析glycoRNA的聚糖结构,不仅为理解其功能提供了关键基础,也拓展了我们对糖基介导细胞间通讯机制的认识和glycoRNA的功能网络。
产品介绍
为了满足深入研究glycoRNA聚糖的需求,云序生物正式推出糖基化RNA糖组质谱分析服务。我们采用高精度nanoAcquity UPLC M-Class System (Waters)液相色谱系统联用ZenoTOF 7600 (SCIEX)质谱仪,助力系统解析glycoRNA分子上糖链的组成、结构,并精准定量聚糖亚型的丰度(如:高甘露糖型、岩藻糖型、唾液酸化型等)。
实验流程:首先利用PNGase F对富集的small RNA进行切割,释放N-聚糖结构。释放出的N-聚糖被纯化后,经过浓缩和干燥即可进行LC-MS/MS分析和数据处理。而O-糖基化RNA在切割N-聚糖后被纯化分离,在碱性条件下释放O-聚糖,经过进一步的脱盐和纯化,即可进行色谱分离和质谱检测分析。
云序优势:
1.先进的高精度技术平台
高分辨率:采用nanoAcquity UPLC M-Class System(Waters)联用ZenoTOF 7600(SCIEX)质谱仪,可覆盖glycoRNA的N-聚糖和O-聚糖型,并区分细微的结构差异(如高甘露糖型、岩藻糖型、唾液酸化型等)。
高灵敏度:UPLC系统可实现对微量样本的高效分离,适用于glycoRNA这类低丰度分子,确保聚糖亚型的准确鉴定和定量。
2.专业化的服务
GlycoRNA是新兴研究方向,其糖组分析需兼顾RNA与糖链的复杂性。云序生物针对性开发的服务填补了市场空白,提供从样本处理到数据分析的一站式解决方案。
3.定制化分析流程和多组学研究支持
定制化分析:可根据研究需求(如免疫调控、神经科学、癌症)提供特定糖型的靶向分析。
多组学研究:结合glycoRNA-seq、RNA-seq等组学数据,解析glycoRNA在细胞信号、免疫调控中的作用
样本要求:
样品类型: 细胞、组织、血液或总RNA,其他样本类型请电询。
样品量:
a.细胞:≥1×10^7
b.组织:≥200mg
c.血液:全血>20ml(推荐用EDTA抗凝采血管,不可用肝素抗凝管)
d.总RNA:≥30µg(或小RNA≥3µg)(RNA N+O糖组质谱分析,RNA≥60μg或小RNA≥6μg,其他样品量翻倍)
样品运输及保存:
样品运输:样品置于1.5mL离心管中,封口膜封好,干冰运输。
样品保存:细胞样品或新鲜组织块可用TRIzol或RNA保护剂处理,液氮冻存后-80℃保存;血液样品应使用EDTA抗凝,不可用肝素;RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80C保存,避免反复冻融。
参考文献
【1】Flynn RA, Pedram K, Malaker SA, et al. Small RNAs are modified with N-glycans and displayed on the surface of living cells. Cell. 2021;184(12):3109-3124.e22.
【2】Perr J, Langen A, Almahayni K, et al. RNA-binding proteins and glycoRNAs form domains on the cell surface for cell-penetrating peptide entry. Cell. 2025;188(7):1878-1895.e25.
【3】Zhang N, Tang W, Torres L, et al. Cell surface RNAs control neutrophil recruitment. Cell. 2024;187(4):846-860.e17.
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云序生物是国家高新技术企业及ISO9001认证单位,以RNA修饰组、表观遗传组与时空组学为特色,依托高通量测序平台,以“技术创新+全链条服务”为核心,通过专利技术应用(如GLORI)、临床微量样本技术优化及单细胞-空间多组学整合能力,持续推动表观遗传与转录组学发展。
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