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Lnc RNA Pull-Down-质谱/MS技术
技术简介:
长链非编码 RNA(lncRNA)作为长度超过 200nt 的重要调控分子,通过与蛋白质的特异性相互作用,广泛参与基因表达调控、细胞命运决定及疾病发生发展等关键生物学过程。深入解析 lncRNA 与蛋白质的互作网络,是揭示其功能机制的核心环节。云序生物依托先进的生物素标记探针技术,推出lncRNA Pull-Down 服务,为从 lncRNA 出发研究蛋白互作提供可靠且高效的解决方案。该技术通过特异性富集与目标 lncRNA 结合的蛋白质,从而构建 lncRNA - 蛋白质调控网络,助力其功能机制研究与疾病相关靶点挖掘。
云序生物 lncRNA Pull-Down 服务基于生物素标记探针的亲和捕获原理:
探针设计与合成:针对目标 lncRNA 序列(如特定功能结构域或保守区域),设计高特异性的生物素标记探针,确保精准靶向目标 lncRNA。
复合物形成:将生物素标记探针与细胞或组织的蛋白提取液共孵育,使探针与结合该 lncRNA 的蛋白质形成lncRNA - 蛋白质复合物。
亲和富集:利用生物素与链霉亲和素的高特异性结合特性,通过链霉亲和素磁珠捕获复合物,高效分离目标 lncRNA 结合蛋白,去除非特异性结合成分。 蛋白鉴定:结合高分辨质谱(MS)可以全面鉴定与目的 lncRNA 相互作用的未知蛋白。
云序lncRNA pull down实验流程
云序优势
高特异性与高效性: 探针针对 lncRNA 独特序列设计,结合严格的阴性对照(如无探针或随机序列探针),最大限度降低非特异性结合。
兼容性强: 适用于多种样本类型(细胞、组织等),可灵活匹配不同研究需求。
全流程质控: 从探针合成到蛋白鉴定,每一步骤均经过严格质量管控,确保数据可靠、结果可重复。
专业的生信信息分析: 提供SCI发表级别的图表。
应用场景
未知互作蛋白筛选与功能挖掘
通过高分辨质谱技术,可从复杂的蛋白提取液中鉴定与 lncRNA 直接结合的未知蛋白质,挖掘潜在的调控因子(如转录因子、RNA 结合蛋白、信号通路关键蛋白等)。
互作网络构建与功能解析
通过整合Pull-Down结果,结合生物信息学分析(如 GO 功能富集、KEGG 通路分析),构建 lncRNA 参与的分子调控网络,揭示其在信号通路或转录调控中的核心作用。
疾病标志物筛选与药物靶点发现
结合临床样本分析,筛选与疾病发生发展密切相关的差异结合蛋白,为医学研究提供候选靶点。
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云序生物是国家高新技术企业及ISO9001认证单位,以RNA修饰组、表观遗传组与时空组学为特色,依托高通量测序平台,以“技术创新+全链条服务”为核心,通过专利技术应用(如GLORI)、临床微量样本技术优化及单细胞-空间多组学整合能力,持续推动表观遗传与转录组学发展。
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