LncRNA测序技术

 

 

 

 lncRNA测序产品列表：

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

技术简介：

 

长链非编码RNA（Long non-coding RNA，lncRNA）是一类长度超过200nt，不编码蛋白质的RNA分子。这类RNA分子在表观遗传水平、转录水平以及转录后等水平调控基因的表达，从而普遍参与动植物的各种生理学过程。此外，还证实lncRNA与ai症、心血管疾病、神经退行性疾病等多种人类疾病密切相关。目前，lncRNA已经取代miRNA成为近几年来耀眼的明星RNA分子，是国际上的研究热点。 云序生物提供全方位的lncRNA 测序解决方案，包括全转录组测序（一次性获取 mRNA、lncRNA、circRNA的完整信息，并获取不同类型RNA间互作关联）和同时分析特定样品中的全部lncRNA和mRNA的lncRNA-seq测序，并根据已知数据库和文献对lncRNA进行详细注释，能够帮助客户筛选与特定生物学过程或疾病相关的lncRNA，并为后续的lncRNA功能和机制研究提供极大的便利。配合云序生物强大的生信分析实力，我们提供的不仅是海量的测序数据，而且是根据您的研究目的，有针对性地挖掘提炼出取之即可用的结果及出版级图片。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

lncRNA 介导的 mRNA 稳定性调节的作用机制

 产品1.全转录组测序

云序生物全转录组测序服务采用去核糖体链特异性建库技术，结合小片段富集筛选策略，可一次性获取 mRNA、lncRNA、circRNA的完整信息。通过整合分析不同类型 RNA 的表达谱与相互作用网络，可以得到：

·共表达网络分析：构建 lncRNA 与 mRNA 的共表达网络，通过分析挖掘 lncRNA 潜在调控的通路或生物学过程（如细胞凋亡、信号传导）

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 lncRNAs 与其与炎症和免疫反应相关的潜在靶基因之间的相互作用网络

 

·动态调控机制：结合不同样本（如疾病 vs 正常组织）的差异表达分析，挖掘 lncRNA 在发育、疾病等过程中的关键作用。

·全转录组测序可涵盖 lncRNA 差异表达分析、临近基因注释、功能富集及互作网络构建，并支持个性化分析。

 

 产品2.lncRNA测序

云序生物lncRNA测序适用于降解样品：

大部分公司采用低成本Oligo d(T)法富集lncRNA，但降解样品中的lncRNA和mRNA会丢失Poly(A)尾巴，从而无法被检测到。云序生物采用特有的，可适用于降解样品的去rRNA试剂盒，能够极大程度地保留降解样品中的lncRNA信息。尤其适合于临床样品的lncRNA检测。

全面检测全部lncRNA：

约有20%的lncRNA没有Poly(A)尾巴，如果采用Oligo d(T)富集法会丢失这部分lncRNA信息。云序生物拥有市面上全的，针对不同物种的去rRNA试剂盒，能够保留全部lncRNA信息。

链特异性检测：

很多mRNA基因位点会生成与转录方向相反的、具有重要调控功能的反义lncRNA。常规建库方法无法区分这些反义lncRNA，而云序生物采用链特异性建库方法，可以准确检测反义lncRNA，提供全 面的lncRNA组信息。

 

 云序技术优势：

一站式服务： 客户只需提供细胞，组织或RNA，云序生物为您完成从样品处理，文库制备，上机测序到数据分析整套服务流程。

个性化分析： 根据研究需求设计个性化分析流程（如 lncRNA-mRNA 共表达网络、功能实验验证方案）。

专业化的生物信息分析： 云序生物具有强大的生物信息学团队，根据客户需求提供lncRNA表达谱、差异互作网络、GO/KEGG通路富集、共表达分析等可视化图表。

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 数据分析（仅供展示 详见报告demo）

1）差异lncRNA的筛选 目的：筛选（Fold Change≥ 2,  P值≤ 0.05）两组或多组样品间的差异表达lncRNA。 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2）以差异表达表中标准化后的count数作为原始数据，使用软件对差异表达RNA进行聚类分析。 其中，红色代表与另一组相比，表达量上调的RNA；蓝色代表与另一组相比，表达量下调的RNA。颜色越深表示上下调幅度越大。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3）差异lncRNA临近靶基因GO和信号通路分析

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

4）lncRNA靶基因共表达网络分析（CNC）※ 利用lncRNA与mRNA的共表达关系，构建lncRNA-mRNA共表达网络图，帮助发现lncRNA的靶基因，并推断lncRNA的功能

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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  lncRNA研究应用场景

疾病机制研究：肿瘤、神经退行性疾病、免疫炎症疾病等中的 lncRNA 标志物筛选与机制解析。

发育生物学：胚胎发育、细胞分化过程中 lncRNA 的动态调控分析。

分子机制研究：lncRNA顺式调控临近基因网络以及参与转录调控与RNA加工。