环状RNA Pull Down-质谱/MS技术

 

 

技术简介：

 

环状 RNA（circRNA）作为一类具有独特闭环结构的非编码 RNA，近年来成为研究热点。它们在基因表达调控、疾病发生发展等过程中发挥着关键作用，深入研究 circRNA 与蛋白质的相互作用，对于揭示 circRNA 的功能机制至关重要。云序生物环状RNA Pull-Down 技术是从环状RNA 出发研究蛋白与环状RNA相互作用的关键技术。环状RNA Pull-Down服务基于生物素标记探针技术，通过高效富集与 circRNA 特异性结合的蛋白质，能够精准解析 circRNA - 蛋白质互作网络，为 circRNA 功能机制研究提供可靠、高效的解决方案。

通过人工合成的、针对 circRNA 反式剪接位点设计的生物素标记探针与细胞蛋白提取液孵育，形成circRNA-蛋白质复合物。该复合物通过生物素 - 链霉亲和素的特异性结合，与链霉亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。环状RNA Pull-Down 结合高分辨质谱可以鉴定与目的 circRNA 相互作用的未知蛋白，筛选其潜在结合蛋白。

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

云序生物circRNA Pull-Down实验流程

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

云序生物RIP环状RNA测序实验流程

云序技术优势：

高特异性与高效性： 云序生物根据circRNA独特的环状结构以及特有的反式剪切位点设计合适的反义探针，同时相对应的正义序列作为对照阴性探针，能够精准识别目标circRNA。

 

具有成熟蛋白质组学平台： 提供circRNA Pull-Down 产物质谱鉴定及WesternBlot。

 

专业的生信信息分析： 提供SCI发表级别的图表。

应用场景

 

circRNA 功能机制研究： 探究 circRNA 通过与哪些蛋白质相互作用发挥其生物学功能，如调控基因表达、参与信号通路等。

 

​ 疾病相关研究： 筛选与疾病发生发展密切相关的 circRNA 及其结合蛋白，为疾病的诊断、治疗和药物研发提供新的靶点和思路。​

 

细胞生物学研究： 研究 circRNA 在细胞增殖、分化、凋亡等过程中与蛋白质的相互作用，揭示细胞生命活动的调控机制。

高分文章案例

 

案例分享：RNA Pull-Down检测circRNA与蛋白质相互作用

 环状RNA是近年来受到关注一类非编码RNA，目前主要认为环状RNA通过miRNA海绵机制调控基因表达，但是对于其更全 面的分子功能知之甚少。这篇文章中作者发现在不同cancer细胞中circ-Foxo3持续少量表达，而在cancer细胞凋亡的过程中，circ-Foxo3表达量明显增加。circ-Foxo3可以促进MDM2介导p53进入素化途径降解，使p53含量下降，同时circ-Foxo3又可以通过阻止MDM2介导Foxo3泛素化而提高Foxo3的表达量。