• RNA修饰质谱技术

     

    目前在真核生物、细菌和古生菌中已鉴定出160多种RNA修饰,这些修饰存在于mRNA、tRNA、rRNA及其他非编码RNA中。常见的RNA修饰包括N6-甲基腺苷(m6A)、假尿苷(Ψ)、N1-甲基腺苷(m1A)、5-甲基胞苷(m5C)、N7-甲基鸟苷(m7G)、和N4-乙酰胞苷(ac4C)等。这些修饰通过影响RNA的剪接、成熟、转运、稳定性和翻译等过程,调控基因表达,进而在生物体的生长发育、代谢及疾病发生中起关键作用。

    然而,由于缺乏合适的检测方法,目前对很多RNA修饰,特别是对低丰度的RNA修饰的功能了解甚少。阐明RNA修饰的生物学意义需要能特异性检测和量化修饰核苷的高灵敏度分析工具。

    云序生物建立了一种基于液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)平台的RNA修饰分析方法,能够同时检测m6A、m5C、ac4c等55种核酸修饰的整体水平,并进行精确的定量。目前所有总体甲基化水平分析方法中只有LC-MS/MS法能够对含量极低的修饰碱基进行准确定性定量,与一定的样品前处理方法相结合,能够更好地对各类生物样品中的RNA修饰进行检测。

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    RNA修饰检测流程示意图

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云序优势

 

1. 广谱修饰分析

一次性筛查55种RNA修饰,涵盖甲基化(m⁶A)、假尿苷(ψ)、乙酰化(ac⁴C)等热门修饰类型

2. 高灵敏度

采用高分辨率质谱,灵敏度高,可检测各类低丰度的RNA修饰

3.高准确性

直接使用高分辨率质谱检测各类,准确性更高;且无需依赖抗体,解决修饰无抗体可用的问题。

依赖高精度的LC-MS/MS平台和强大的生信分析团队,云序生物可同时检出55类核酸修饰的总体水平,并提供各修饰类型在样品间的相对差异程度及显著性分析。