环状RNA研究
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环状RNA实时定量PCR

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类新型非编码RNA分子,它在真核生物中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中最炙手可热新星。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育和疾病发生发展密切相关。此外,环状RNA比线性RNA更稳定,可作为新型疾病分子标志物。 

实时定量RT-PCR是检测RNA表达的金标准,但环状RNA的实时定量PCR检测存在着特殊的挑战:1). 环状RNA为闭合环形结构,只有采取Outward-facing primer设计策略才能把它们和线性RNA区分开;2). 没有环状RNA的序列数据库,很难获取其序列信息;为了促进环状RNA的研究,云序生物全新推出了环状RNA实时定量PCR技术服务。

云序生物环状RNA实时定量 PCR服务流程

云序生物提供一站式环状RNA实时定量PCR技术服务,包括:RNA抽提,RNA质控,环状RNA特异性引物设计,环状RNA逆转录,环状RNA qPCR检测。并提供详细的实验报告和实验数据。


 


1). “Outward-facing”引物设计策略

云序生物针对环状RNA特异性的backsplice位点,采用了outward-facing引物设计策略:针对线性RNA,primer 1和primer 2是尾对尾,无法有效扩增;而如果线性RNA的外显子1和3收尾相连形成了闭合的环状RNA, primer 1和2就可以扩增出针对特异性backsplice位点的产物,从而特异性的检测环状RNA。

 

2). 预验证的引物

云序生物根据权威文献和数据库整理了数万个人类和小鼠环状RNA,预设计了它们的PCR引物,并对其中一些常见的环状RNA在组织和细胞系中进行了预验证。从而帮客户节省了大量引物设计和测试的时间,并保证了实验的成功。

 

细胞,新鲜组织,血清血浆,石蜡包埋样品,抽提好的RNA



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