蛋白组学和代谢组学
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靶向代谢组学分析

靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对特定的代谢物群进行有针对性地、特异性地检测与分析。通常采用的技术方案包括常规的液质联用(LC-MS)分析技术,以及选择性反应/多反应监测技术(MRM/ SRM)。

常规分析法首先利用LC-MS的方法对待分析样本进行大规模代谢组分析,然后通过与相同分析条件下标准品的分析结果进行比对,实现对样本内目标代谢群的定性和定量分析。


MRM/SRM技术是更为特异、灵敏的靶向分析方法。其主要基于已知或假定的反应离子信息,有针对性地选择数据进行质谱信号采集,对符合规则的离子对进行信号记录,去除不符合规则离子信号的干扰。定量过程中,该技术首先筛选到目标代谢物特异性的母离子,然后选择性地对这些母离子进行碰撞诱导,去除其他离子的干扰,只对选定的特异MS/MS2离子进行质谱信号的采集,从而实现对目标代谢分子更为特异、灵敏、准确的分析。


常规分析法:

高通量分析能力,相比于MRM/SRM简便、经济

MRM/SRM:

高通量分析能力,兼具高选择性、高特异性、高准确度、高重现性、高灵敏度、宽动态范围

拥有标准化的实验室操作规范和先进的靶向技术平台,实验周期短,质量可靠

严格的方法验证步骤,多重质控保证实验可靠

拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务

案例:多胺的血浆、尿液靶向代谢组学开发

案例描述:

多胺是低分子量的脂肪族氨基酸,它能和DNA, RNA, 酸性磷酸脂类和蛋白进行相互作用,对细胞生长、延长和蛋白和核酸的合成具有显著的作用。多胺在肿瘤的biomarker的早期诊断和治疗也起到了关键的作用。在本研究中,我们第一次用UHPLC-MS/MS方法开发了14种多胺在血浆和尿液中的检测方法。并进行了20个正常人和肝癌病人的血浆和尿液检测。

图例展示:


研究结果:

1.  建立了14种多胺的UHPLC-MS/MS的检测方法。各项指标均符合标准。

2.  肝癌病人血浆结果表明,putrescine和spermidine可能为biomarker, spermidine和N-acetylspermidine在尿液中可能为biomarker。

数据前处理

PCA 分析

PLS-DA 分析

差异代谢物筛选

差异代谢物鉴定

代谢通路分析

样品浓度及需求量:

植物样本最少200mg,血液样品至少1ml(血浆注意用肝素钠防凝),血清0.5ml,尿液2ml,动物组织样品至少1g,细胞样品为1X107个细胞,酵母、微生物等干重200mg,其它样本类型请于来电咨询云序生物技术支持。

样本的保存:

根据不同样品类型,样品请置于不同大小的离心管中,具体请向销售咨询。

样品运输:以3-4公斤干冰挥发一天计算,请使用足量的干冰运输(建议尽量选用较大块的干冰,大块的干冰挥发较慢),并用泡沫盒封闭。并且尽量选用较快的邮递方式,以降低运输过程中样品降解的可能性。


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